从感染到出现症状约为2-10天，平均3-5天。临床表现多以发热，口腔粘膜出现疱疹，手、足和臀部出现斑丘疹、疱疹为主，可伴有咳嗽、流涕、食欲不振等症状。
患儿通常病情症状较轻，呈自限性，一般预后良好，7-10天病程后可完全康复。少数重症患者儿的病情会快速恶化，出现神经系统并发症和多器官衰竭，严重者可导致死亡。感染CVA6、CVA10的少部分患者在病后2～4周可能会出现脱甲症状。
患者和隐性感染者为手足口病传染源，隐性感染比例较大。
患者发病前具有传染性，通常以发病后1周内传染性最强。 
传播途径多样且容易实现，主要的传播方式为密切接触传播，通过直接接触病人的粪便、疱疹液、鼻咽分泌物、唾液及接触被污染的手、毛巾、手绢、牙杯、玩具、餐具、奶瓶、床上用品等物品或环境而感染;还可通过呼吸道飞沫传播，如咳嗽、打喷嚏等;饮用或食入被病毒污染的水和食物亦可感染。
手足口病的预防
●避免接触患儿
尽量不要与患儿拥抱、分享玩具、共用餐具和洗浴用品等，防止交叉感染。
●保持手卫生
良好的手卫生是预防手足口病的有效措施。
●减少聚集
人群聚集、接触频繁，容易传播手足口病。
●环境通风
密闭公共场所和居室要经常通风，保持空气流通。
●清洁消毒
门把手、台面等接触频繁的部位、日常用品和儿童玩具定期清洁和消毒;奶具、餐具等要煮沸消毒;衣物、被褥经常在太阳下晾晒或用紫外线灯照射消毒
EV-A71型灭活疫苗可用于6月龄～5岁儿童预防EV-A71感染所致的手足口病，减少手足口病重症和死亡的发生，鼓励在12月龄前完成接种。
